基础理论
捕捉系统贯穿了本作始终，野外明雷触发后，都需要通过捕捉系统来捕获宝可梦并获得经验。因为这一作没有了野外草丛遇敌，所以除去跟训练师对战以外，捕捉系统就是本作最大的经验来源。
野外的宝可梦从外观上分为了普通宝可梦、Big宝可梦、Small宝可梦、闪光宝可梦。
Big宝可梦是该种宝可梦中较大体体型的宝可梦，宝可梦身躯外有红色圈层环绕。Small宝可梦则是较小的，宝可梦身躯外有蓝色圈层环绕。两种宝可梦都相对于该种普通的宝可梦更难捕捉，但同时奖励倍率也高一些。闪光宝可梦外观颜色是异色，身躯外会有微弱的亮晶晶特效，捕捉之前建议先查询下相应宝可梦闪光颜色，方便捕捉。
在捕捉界面，宝可梦身上会有内外两个圆圈，白色外圈是精灵球可投掷范围，只要精灵球投掷在白圈范围内，才能判定成功投掷在宝可梦身上。
内圈颜色根据当前玩家使用的精灵球级别和宝可梦捕捉难度等决定，绿色代表容易捕捉，黄色代表有一定难度，橙色则是较难捕捉，红圈则代表非常难捕获。内圈会在外圈内，不断变大缩小，精灵球投掷在内圈范围内会更容易捕获。根据投中内圈时内圈大小，分为漂亮一投Nice 、精彩一投Great和极致一投Excellent，获得的奖励倍率越高。
多次捕捉同一种宝可梦，虽然捕捉概率不会变动，但是也会对捕获难易度进行修正，变得容易捕捉，大约捕获同种宝可梦达到100只左右，即便只使用精灵球投掷在外圈内，也可以一击捕获。
从上到下图分别是绿圈、黄圈、橙圈
奖励倍率
捕获宝可梦的经验会随着投掷精灵球技巧和宝可梦尺寸等有所区别，大致分为下列几类，每种情况奖励倍率不同。
成功捕捉 基础倍率
捕获新宝可梦 奖励倍率
投掷精灵球技巧加分 分为漂亮一投Nice ；精彩一投Great!!；极致一投Excellent；一击中的。
尺寸奖励 有两种，分为Big宝可梦和Small宝可梦。
连续捕捉奖励 连续捕捉同种宝可梦(即连锁)奖励
连锁系统
连锁系统，就是玩家通过不断捕捉同一种宝可梦，提升连锁次数以增加遇见的宝可梦个体和闪光几率。在NGA水友 [@xxgbj] 的[原创翻译贴]中已详细搬运翻译了[雪拉比网]的资讯，具体可参照原帖。
通常刷连锁，可以携带好香水(引虫香水、白银香水、黄金香水)等吸引宝可梦。如果只是为了捕获闪光宝可梦，可以在连锁达到31以上时候，选择原地不动挂机方式等待闪光宝可梦刷新，这样可以大量节约香水。后期学会飞行以后，可以在空中蹲点等待闪光。
捕获其他宝可梦则连锁中断。这里的其他包括了进化链中的宝可梦，即当你连锁妙蛙种子，捕捉妙蛙花、妙蛙草也是会中断连锁的。
捕捉过程中，宝可梦逃跑则连锁中断。这里只针对宝可梦逃跑，如果玩家先手逃跑则不会判定连锁中断
存档不中断连锁，但是读档直接中断连锁。
凌空渡飞往远处城市或者前往其他城市是不会中断连锁的。（点击进入>>稀有宝可梦刷新点）
连锁奖励加成
通过不断连锁，遇到的宝可梦个体值、闪光和稀有宝可梦几率会提升，捕获获得的糖果奖励数量和品质也会提高。
连锁宝可梦个体情况
下表代表了连锁宝可梦次数和捕获宝可梦的个体情况。
连锁宝可梦持有道具和香水异色/闪光概率
同一片草丛，所有的宝可梦都享受下表中连锁所带来的概率加成。为了节约香水，可以在满足31连锁情况下，原地等待闪光宝可梦刷新。
连锁遇见稀有宝可梦概率
19游戏网整理报道